Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm37983-201ENSMUST00000193207 2006 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 AC159193.1-201ENSMUST00000222872 2517 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 CT025536.1-201ENSMUST00000226744 844 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm3604-201ENSMUST00000107989 1677 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Vmn1r71-204ENSMUST00000227702 5034 ntAPPRIS P2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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Usp48Q3V0C5 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Piga-201ENSMUST00000033754 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Usp48Q3V0C5 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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