Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Gm43268-201ENSMUST00000201536 4055 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Cldn18P56857 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm29633-204ENSMUST00000187737 675 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr187-201ENSMUST00000206428 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 2610306O10Rik-201ENSMUST00000206512 612 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm44594-201ENSMUST00000208982 407 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr382-201ENSMUST00000092921 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Slc25a36-201ENSMUST00000035024 4043 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr799-204ENSMUST00000216446 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm14880-201ENSMUST00000117581 292 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm20612-201ENSMUST00000176318 236 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm26297-201ENSMUST00000179464 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm43746-201ENSMUST00000200028 317 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Cldn18P56857 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Cldn18P56857 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Cldn18P56857 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr1028-201ENSMUST00000080698 3474 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm25883-201ENSMUST00000157781 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Olfr772-201ENSMUST00000169800 1004 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Cldn18P56857 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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