Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Cyp2b26-ps-201ENSMUST00000206238 1090 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm11213-202ENSMUST00000210529 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 AC093926.1-201ENSMUST00000213730 243 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Vmn1r89-203ENSMUST00000227176 4189 ntAPPRIS P2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr351-201ENSMUST00000100150 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm15025-201ENSMUST00000118434 418 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm13678-201ENSMUST00000118926 340 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm43848-201ENSMUST00000198060 1247 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr581-ps1-201ENSMUST00000209214 556 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Bcl2a1b-201ENSMUST00000068569 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Olfr33-202ENSMUST00000216312 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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Ccl20O89093 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 AC120540.1-201ENSMUST00000221879 324 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr1453-201ENSMUST00000087773 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Gm8675-201ENSMUST00000201408 1856 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Ccl20O89093 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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