Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm26411-201ENSMUST00000157668 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 5430402E10Rik-201ENSMUST00000063127 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm22228-201ENSMUST00000157364 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC192334.1-201ENSMUST00000221832 1268 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm28614-201ENSMUST00000186483 458 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC155715.1-201ENSMUST00000213575 463 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC117814.1-201ENSMUST00000226135 352 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm6207-201ENSMUST00000120075 1386 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm6228-201ENSMUST00000178856 1386 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Rtl4-201ENSMUST00000096301 1758 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr360-201ENSMUST00000120704 954 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Prl3d2-202ENSMUST00000164964 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Usp9yF8VPU6 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm14602-201ENSMUST00000118625 340 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm42967-201ENSMUST00000198647 2312 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Usp9yF8VPU6 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms