Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm24581-201ENSMUST00000103962 133 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm43214-201ENSMUST00000199242 352 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 4930512M02Rik-201ENSMUST00000081896 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 4932414N04Rik-204ENSMUST00000128259 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 9330159F19Rik-202ENSMUST00000213489 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr1309-206ENSMUST00000217452 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Hmgb1-ps1-201ENSMUST00000119350 634 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28039-201ENSMUST00000149128 254 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm26148-201ENSMUST00000157430 68 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC187103.4-202ENSMUST00000225091 230 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm37045-201ENSMUST00000192016 2463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Syne1-205ENSMUST00000215295 27908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14299-201ENSMUST00000117586 397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm12691-201ENSMUST00000120186 456 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm15267-201ENSMUST00000120888 464 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm28069-201ENSMUST00000189926 214 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm36954-201ENSMUST00000195362 363 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm44718-201ENSMUST00000206886 359 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
RabggtaQ9JHK4 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms