Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Mir700-201ENSMUST00000102169 79 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 1810006J02Rik-202ENSMUST00000191060 523 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm18444-201ENSMUST00000191239 629 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Wdr49-201ENSMUST00000193989 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Olfr668-202ENSMUST00000215359 3613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn2r120-201ENSMUST00000165781 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm14782-201ENSMUST00000120151 195 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm7713-201ENSMUST00000181201 1007 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm45069-201ENSMUST00000208604 317 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Defb39-201ENSMUST00000075504 252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Spef2-204ENSMUST00000160236 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Foxd4Q60688 Gm5128-202ENSMUST00000180198 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm23662-201ENSMUST00000158046 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Olfr1263-202ENSMUST00000214382 4400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm38125-201ENSMUST00000194136 3438 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn1r51-209ENSMUST00000227911 4021 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Atm-201ENSMUST00000118282 10006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Foxd4Q60688 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms