Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 4930431P03Rik-202ENSMUST00000166127 4237 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm22113-201ENSMUST00000158343 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm44515-201ENSMUST00000209045 379 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm3816-201ENSMUST00000209803 433 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm23625-201ENSMUST00000082457 100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm37387-201ENSMUST00000192201 1806 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Kynu-201ENSMUST00000028223 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Zbed4-ps1-201ENSMUST00000186734 3466 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm12110-201ENSMUST00000121601 579 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Jakmip1-216ENSMUST00000212997 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC120555.1-201ENSMUST00000221020 222 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm9077-201ENSMUST00000210657 2298 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Olfr1250-203ENSMUST00000215730 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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PtpreP49446 Gm22984-201ENSMUST00000122751 122 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Uba6-201ENSMUST00000039373 6590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
PtpreP49446 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
PtpreP49446 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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