Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC132384.9-201ENSMUST00000218085 277 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Hspd1-ps1-201ENSMUST00000203513 1670 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm14403-201ENSMUST00000108940 774 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 B3galt2-201ENSMUST00000038252 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Skint9-201ENSMUST00000058605 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC107808.2-201ENSMUST00000213542 1027 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Slco6c1-202ENSMUST00000189547 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Pbsn-202ENSMUST00000114041 697 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24875-201ENSMUST00000158888 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm28917-201ENSMUST00000187294 237 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm28766-201ENSMUST00000191086 234 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm45038-201ENSMUST00000207537 3838 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
Hoxd10P28359 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.1 ms