Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22725-201ENSMUST00000158092 110 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm25861-201ENSMUST00000158251 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm26362-201ENSMUST00000158865 315 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 AC164883.9-201ENSMUST00000228042 399 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Defb40-201ENSMUST00000066258 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22741-201ENSMUST00000083438 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd9P28357 Olfr1014-202ENSMUST00000213453 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 1700023F02Rik-203ENSMUST00000189619 473 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm18188-201ENSMUST00000219386 478 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC133076.2-201ENSMUST00000227678 3532 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm43834-201ENSMUST00000197097 4830 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 1700129L04Rik-202ENSMUST00000189291 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm11115-201ENSMUST00000113255 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25599-201ENSMUST00000157816 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm1833-201ENSMUST00000191608 682 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd9P28357 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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