Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Ptprd-203ENSMUST00000098005 4542 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Tdrkh-202ENSMUST00000166032 5692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Rnf2-204ENSMUST00000187048 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm24938-201ENSMUST00000102225 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Hist1h4f-201ENSMUST00000102971 391 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Defb28-201ENSMUST00000121912 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Gm21887J3QQ04 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Gm21887J3QQ04 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Gm21887J3QQ04 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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Gm21887J3QQ04 Rasgrf1-201ENSMUST00000034909 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Gm21887J3QQ04 n-R5s28-201ENSMUST00000082814 119 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Mir146-201ENSMUST00000083667 65 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Vmn1r220-204ENSMUST00000227950 6238 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Nlrp4a-201ENSMUST00000068767 4259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Olr1-201ENSMUST00000032265 3572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Gm29461-201ENSMUST00000189232 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Gm21887J3QQ04 Macc1-205ENSMUST00000222784 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Gm21887J3QQ04 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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