Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Olfr818-203ENSMUST00000215527 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
VdrP48281 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
VdrP48281 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
VdrP48281 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
VdrP48281 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Ccna2-205ENSMUST00000196316 2001 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24544-201ENSMUST00000103862 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Psmb7-ps2-201ENSMUST00000118546 820 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Cyp4b1-ps1-201ENSMUST00000118753 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22036-201ENSMUST00000157279 215 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25801-201ENSMUST00000082638 106 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Mir199a-2-201ENSMUST00000093618 110 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 2810429I04Rik-209ENSMUST00000188642 674 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm42643-201ENSMUST00000200504 279 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Smcp-201ENSMUST00000098888 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm6134-201ENSMUST00000117265 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Olfr337-ps1-201ENSMUST00000120380 456 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm11825-201ENSMUST00000120710 736 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm22480-201ENSMUST00000122568 128 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
VdrP48281 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms