Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ednra-201ENSMUST00000034029 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37928-201ENSMUST00000193265 4131 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37655-201ENSMUST00000193968 4123 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Eif2ak4-204ENSMUST00000110870 5116 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gucy2g-201ENSMUST00000069183 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ifi207-202ENSMUST00000127730 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Zkscan5-201ENSMUST00000031601 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37169-201ENSMUST00000195599 4161 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 2900079G21Rik-202ENSMUST00000144424 2944 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Pgr15l-201ENSMUST00000033556 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Pfkfb3-206ENSMUST00000114846 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm40518-202ENSMUST00000214538 4080 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Dock1-201ENSMUST00000084488 6807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slx4ip-202ENSMUST00000099311 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Zfp148-201ENSMUST00000089677 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Usp54-201ENSMUST00000022356 6580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Arhgap17-204ENSMUST00000205262 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Sox6-201ENSMUST00000072804 8227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Tktl1-201ENSMUST00000010127 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Wdfy3-207ENSMUST00000212024 10539 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ddb1-201ENSMUST00000025649 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm44120-201ENSMUST00000203022 3023 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm45660-201ENSMUST00000210267 151 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rai14-207ENSMUST00000227506 4732 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rfx6-201ENSMUST00000050455 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Osbpl3-204ENSMUST00000114468 6494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cdk6-202ENSMUST00000165117 11525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn2r60-201ENSMUST00000166447 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slc4a10-201ENSMUST00000054484 5320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Kcnma1-203ENSMUST00000100831 3261 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr753-ps1-203ENSMUST00000208970 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Adarb2-201ENSMUST00000064473 6721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ddr2-202ENSMUST00000170800 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr1062-203ENSMUST00000217481 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm9866-203ENSMUST00000182592 8487 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mgat4a-205ENSMUST00000151952 7251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Kif24-202ENSMUST00000108055 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Pfkfb3-201ENSMUST00000028114 4712 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Supt7l-204ENSMUST00000201769 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gpatch2-208ENSMUST00000160570 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr107-203ENSMUST00000215947 3954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Stat1-201ENSMUST00000070968 5151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm11749-201ENSMUST00000127327 184 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm24303-201ENSMUST00000178237 126 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm27152-201ENSMUST00000183828 99 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Arhgap1-201ENSMUST00000090614 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Hecw2-203ENSMUST00000120904 11263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slc38a1-203ENSMUST00000100262 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Atp2b4-203ENSMUST00000125659 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Il1rap-203ENSMUST00000166294 3200 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Runx1t1-203ENSMUST00000098257 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm37206-201ENSMUST00000195512 3069 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms