Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Olfr753-ps1-201ENSMUST00000174025 3121 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm14406-201ENSMUST00000108943 531 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm11550-201ENSMUST00000118210 699 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm13435-201ENSMUST00000120111 1023 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 AC121286.1-201ENSMUST00000218811 380 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Snora23-201ENSMUST00000082517 184 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Mir496a-201ENSMUST00000093627 79 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Olfr330-202ENSMUST00000213188 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Ighv1-34-201ENSMUST00000103512 388 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Nectin3-206ENSMUST00000121803 541 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm25106-201ENSMUST00000122672 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Mir27a-201ENSMUST00000083510 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Inpp4b-203ENSMUST00000109852 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Zfp607a-203ENSMUST00000205715 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Ogt-202ENSMUST00000119299 3840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm12311-201ENSMUST00000118803 374 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PdgfaP20033 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms