Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr160-201ENSMUST00000104875 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21980-201ENSMUST00000180032 143 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 1700015G11Rik-203ENSMUST00000185841 305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 AC154808.1-201ENSMUST00000223156 730 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Mir218-2-201ENSMUST00000083649 110 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FxnO35943 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Olfr1290-204ENSMUST00000217611 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm11481-201ENSMUST00000120069 255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21842-202ENSMUST00000185311 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29285-201ENSMUST00000185500 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21801-202ENSMUST00000185537 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28312-201ENSMUST00000185976 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29213-201ENSMUST00000186199 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21428-201ENSMUST00000186550 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29370-201ENSMUST00000186581 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21633-202ENSMUST00000186630 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28890-201ENSMUST00000186686 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28092-201ENSMUST00000186709 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21572-202ENSMUST00000186850 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21916-202ENSMUST00000187044 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29839-201ENSMUST00000187045 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28442-201ENSMUST00000187052 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21780-202ENSMUST00000187110 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29656-201ENSMUST00000187236 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21821-202ENSMUST00000187288 175 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28886-201ENSMUST00000187350 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21599-202ENSMUST00000187381 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28128-201ENSMUST00000187403 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21450-201ENSMUST00000187408 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28689-201ENSMUST00000187441 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28851-201ENSMUST00000187800 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FxnO35943 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms