Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm44092-201ENSMUST00000204470 258 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC171206.2-201ENSMUST00000215252 389 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm30624-201ENSMUST00000220039 628 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm37087-201ENSMUST00000192966 3309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm37752-201ENSMUST00000193494 3309 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr906-202ENSMUST00000214344 3775 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Homer2-202ENSMUST00000098326 10982 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm30280-201ENSMUST00000192214 262 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ighv1-21-1-201ENSMUST00000195790 351 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Mme-205ENSMUST00000194134 8039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn1r71-201ENSMUST00000079113 4996 ntAPPRIS P2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm25875-201ENSMUST00000104323 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11699-201ENSMUST00000119016 401 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm24629-201ENSMUST00000122762 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps40-201ENSMUST00000172862 343 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm29926-201ENSMUST00000201443 660 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm10719-202ENSMUST00000099049 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Xkrx-201ENSMUST00000033611 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Postn-201ENSMUST00000073012 3189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr49-202ENSMUST00000216214 5717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Zfp62-202ENSMUST00000109197 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Limd1Q9QXD8 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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