Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm25293-201ENSMUST00000122792 285 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28565-202ENSMUST00000186615 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28297-201ENSMUST00000186679 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm34176-201ENSMUST00000192621 474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr505-ps1-201ENSMUST00000207626 976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm5750-201ENSMUST00000218711 801 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr1192-ps1-201ENSMUST00000120518 2738 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mannr-201ENSMUST00000193549 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Btf3l4-204ENSMUST00000102742 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 4932411N23Rik-201ENSMUST00000081074 3407 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm15120-201ENSMUST00000120602 301 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm26310-201ENSMUST00000157766 117 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm16213-201ENSMUST00000160076 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm24611-201ENSMUST00000083272 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r89-204ENSMUST00000227239 1992 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13046-201ENSMUST00000117391 501 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm11936-201ENSMUST00000118323 160 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 3110004A20Rik-201ENSMUST00000123904 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm16220-201ENSMUST00000131874 405 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Egfros-201ENSMUST00000150329 4063 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm19498-201ENSMUST00000191128 331 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Rabgef1Q9JM13 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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