Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm30667-201ENSMUST00000193120 870 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44076-201ENSMUST00000203072 520 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12603-202ENSMUST00000146678 618 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr966-ps1-201ENSMUST00000214875 577 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Rps15a-ps2-201ENSMUST00000087473 393 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1289-201ENSMUST00000120021 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14877-201ENSMUST00000119803 478 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr576-202ENSMUST00000185326 927 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Ighv1-46-201ENSMUST00000193988 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3933-201ENSMUST00000195391 439 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19244-201ENSMUST00000204340 253 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr852-ps1-201ENSMUST00000212273 226 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm22072-201ENSMUST00000116850 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45551-201ENSMUST00000211459 928 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 CT573085.1-201ENSMUST00000224279 1197 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Cd226-202ENSMUST00000097496 911 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC2.54□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm24274-201ENSMUST00000116787 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7247-201ENSMUST00000162998 1157 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28981-201ENSMUST00000190863 1288 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.53□□□□□ -2
H2-M10.5Q85ZW7 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.5 ms