Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 AI847159-204ENSMUST00000148997 753 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm37162-201ENSMUST00000191708 551 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm43464-201ENSMUST00000198003 317 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm26922-201ENSMUST00000082687 72 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm23460-201ENSMUST00000083258 109 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm37303-201ENSMUST00000194202 1559 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 AC153975.1-201ENSMUST00000220087 926 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Vmn2r59-201ENSMUST00000168489 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Clhc1-201ENSMUST00000020753 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
PtprmP28828 Vmn1r178-204ENSMUST00000226640 2282 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Tug1-201ENSMUST00000132077 6719 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
PtprmP28828 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm17194-201ENSMUST00000164610 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 AC117656.3-204ENSMUST00000225656 859 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Mup-ps14-201ENSMUST00000118437 532 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm11344-201ENSMUST00000122011 335 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Mup-ps2-201ENSMUST00000142602 533 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 1700063A18Rik-201ENSMUST00000190901 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm44521-201ENSMUST00000206469 217 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm42483-201ENSMUST00000197556 1742 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm24890-201ENSMUST00000104389 102 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm12495-201ENSMUST00000119750 447 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm43406-201ENSMUST00000200356 334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm5655-201ENSMUST00000221078 901 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 CT030662.1-201ENSMUST00000227380 232 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm37402-201ENSMUST00000194525 5000 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm23960-201ENSMUST00000157206 131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm37059-201ENSMUST00000191723 678 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
PtprmP28828 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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