Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm25748-201ENSMUST00000175487 70 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 4930520M14Rik-201ENSMUST00000196947 701 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 C78859-201ENSMUST00000212800 5943 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Cfap46-202ENSMUST00000129990 8180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm10556-201ENSMUST00000180904 3906 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm13972-201ENSMUST00000153726 3164 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm14615-201ENSMUST00000117575 1816 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Atad2-208ENSMUST00000228783 3472 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 4932431L22Rik-201ENSMUST00000193456 3140 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Myt1-201ENSMUST00000081125 5327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Pcdhb13-201ENSMUST00000056915 3710 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Ogdhl-201ENSMUST00000022480 3449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Bnc2-201ENSMUST00000102820 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm24824-201ENSMUST00000175097 78 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm28179-202ENSMUST00000189029 327 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Slc22a8-201ENSMUST00000010251 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Npy6r-201ENSMUST00000042747 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Vmn1r51-203ENSMUST00000226542 4164 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Dgkh-206ENSMUST00000228362 3308 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Lingo2-210ENSMUST00000164772 3562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Tmc5-204ENSMUST00000121744 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Greb1-212ENSMUST00000162112 8058 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 5031434C07Rik-202ENSMUST00000188014 3244 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm15348-201ENSMUST00000151188 3655 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Prom1-203ENSMUST00000087441 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Prdm11-202ENSMUST00000111274 11678 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Tecta-201ENSMUST00000042190 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Igkv4-53-201ENSMUST00000166380 292 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 4933440M02Rik-201ENSMUST00000061823 3801 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm25644-201ENSMUST00000083209 107 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Polr3a-201ENSMUST00000026322 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Psg27-201ENSMUST00000094794 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Zfp800-201ENSMUST00000035930 3881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cfap61-206ENSMUST00000133433 3998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Nf1-201ENSMUST00000071325 11917 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Prpf4b-201ENSMUST00000077853 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr127-202ENSMUST00000217223 3733 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Unc79-208ENSMUST00000179002 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Bbx-208ENSMUST00000138166 8743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Fam111a-204ENSMUST00000151307 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm42842-201ENSMUST00000197736 3004 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Tenm4-202ENSMUST00000107165 10930 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cntn1-204ENSMUST00000169825 5671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm25828-201ENSMUST00000157087 95 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
Hoxd11P23813 Pik3cg-207ENSMUST00000220366 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
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