Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 4930428D20Rik-201ENSMUST00000201886 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm44402-201ENSMUST00000203677 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Dnah7c-204ENSMUST00000189749 12207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC154374.1-201ENSMUST00000215351 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm18507-201ENSMUST00000218855 525 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC119241.1-201ENSMUST00000223651 534 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr1249-202ENSMUST00000216124 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Gnrhr-203ENSMUST00000113372 2265 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
RpainQ9CWY9 Ifi203-203ENSMUST00000123708 3482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm11577-201ENSMUST00000118030 737 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Ifna-ps1-201ENSMUST00000119856 555 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm43710-201ENSMUST00000199583 452 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
RpainQ9CWY9 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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