Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22769-201ENSMUST00000158367 98 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm23581-201ENSMUST00000158531 63 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Mir6481-201ENSMUST00000184617 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm8939-201ENSMUST00000192577 964 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22155-201ENSMUST00000083836 162 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm23014-201ENSMUST00000104144 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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ptchd1Q14B62 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Krtap24-1-201ENSMUST00000052512 1571 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Slfn8-203ENSMUST00000108152 3083 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Hrnr-202ENSMUST00000093774 11187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Olfr1389-202ENSMUST00000216641 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Msr1-202ENSMUST00000170091 3636 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Gm37764-201ENSMUST00000194664 2150 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ptchd1Q14B62 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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