Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr1124-201ENSMUST00000062494 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mkln1-201ENSMUST00000026699 11395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm7470-201ENSMUST00000194219 2095 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr483-202ENSMUST00000215159 2691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Enam-202ENSMUST00000199104 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm12584-201ENSMUST00000117109 1105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm13686-201ENSMUST00000122851 350 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm8267-202ENSMUST00000169062 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm43198-201ENSMUST00000200927 326 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC159297.2-201ENSMUST00000219567 1075 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC134596.2-201ENSMUST00000222158 171 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC124562.1-201ENSMUST00000224673 337 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 AC154358.1-201ENSMUST00000224871 218 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Tex36-201ENSMUST00000033275 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn1r12-201ENSMUST00000073384 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr502-202ENSMUST00000216919 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn2r-ps69-201ENSMUST00000173382 2565 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Traj12-201ENSMUST00000103729 58 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm25420-201ENSMUST00000104216 127 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm13873-201ENSMUST00000119208 427 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm10292-201ENSMUST00000183142 581 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 4930452N14Rik-201ENSMUST00000189240 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm9023-201ENSMUST00000198408 1038 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm18194-201ENSMUST00000210455 481 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr811-202ENSMUST00000215058 2508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm37143-201ENSMUST00000195180 3259 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Spatc1Q148B6 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spatc1Q148B6 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spatc1Q148B6 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Spatc1Q148B6 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spatc1Q148B6 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Spatc1Q148B6 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms