Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm37416-201ENSMUST00000193596 318 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm37738-201ENSMUST00000192396 4716 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm45324-201ENSMUST00000211193 5638 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Zfp353-ps-201ENSMUST00000107130 1650 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Scarna13-201ENSMUST00000158164 275 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
ArxO35085 Nae1-201ENSMUST00000034349 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm15244-201ENSMUST00000121122 130 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm13901-201ENSMUST00000137252 468 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm40548-201ENSMUST00000223522 644 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr1204-201ENSMUST00000078631 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm40909-202ENSMUST00000223275 5564 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC126673.1-201ENSMUST00000223208 3856 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm43871-201ENSMUST00000204931 1955 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm17159-201ENSMUST00000169043 482 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Gm43238-201ENSMUST00000196463 359 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
ArxO35085 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms