Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Smarca2-220ENSMUST00000207054 2333 ntTSL 5 BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Rgs7-207ENSMUST00000195324 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm11971-201ENSMUST00000117715 288 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm23179-201ENSMUST00000158693 304 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm25815-201ENSMUST00000082755 107 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm37018-201ENSMUST00000192441 3869 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr985-202ENSMUST00000214981 1879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Mir599-201ENSMUST00000102378 88 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm15643-201ENSMUST00000126556 383 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm16545-201ENSMUST00000161968 463 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Gm9134-201ENSMUST00000193186 551 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Nipal1-201ENSMUST00000087212 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Tmem67-201ENSMUST00000050686 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Hdac5Q9Z2V6 Olfr473-202ENSMUST00000217618 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 AC123705.2-201ENSMUST00000221653 2009 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 4930402H24Rik-203ENSMUST00000119422 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm14656-201ENSMUST00000120342 502 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24540-201ENSMUST00000177627 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25256-201ENSMUST00000177746 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm22822-201ENSMUST00000177941 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Rnu6-201ENSMUST00000178023 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24753-201ENSMUST00000178183 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25829-201ENSMUST00000178275 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm22092-201ENSMUST00000178290 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24486-201ENSMUST00000178420 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm23217-201ENSMUST00000178482 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24019-201ENSMUST00000178620 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm23092-201ENSMUST00000178688 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25709-201ENSMUST00000178844 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25547-201ENSMUST00000178877 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25312-201ENSMUST00000178972 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24722-201ENSMUST00000179017 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm22969-201ENSMUST00000179018 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24873-201ENSMUST00000179101 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm23934-201ENSMUST00000179111 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm22623-201ENSMUST00000179244 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26243-201ENSMUST00000179260 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25737-201ENSMUST00000179274 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm22618-201ENSMUST00000179376 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24182-201ENSMUST00000179419 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm24242-201ENSMUST00000179440 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm25064-201ENSMUST00000179535 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Hdac5Q9Z2V6 Gm26295-201ENSMUST00000179690 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms