Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr775-201ENSMUST00000097163 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm44846-201ENSMUST00000207127 3243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm5935-201ENSMUST00000101667 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm45272-202ENSMUST00000209875 502 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm9818-201ENSMUST00000050900 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 C87977-201ENSMUST00000105753 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr188-ps1-201ENSMUST00000205766 4706 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm16383-201ENSMUST00000118122 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm11446-201ENSMUST00000121319 866 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm38080-201ENSMUST00000194035 268 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm5653-201ENSMUST00000223393 1337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1402-202ENSMUST00000199297 4051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm43841-201ENSMUST00000199491 586 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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Col5a3Q9JLI2 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Col5a3Q9JLI2 1700067G17Rik-201ENSMUST00000186180 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Col5a3Q9JLI2 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Olfr1187-ps1-201ENSMUST00000177576 334 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm7753-201ENSMUST00000221007 867 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 Trav14-1-201ENSMUST00000198297 399 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Col5a3Q9JLI2 AC124399.1-201ENSMUST00000218334 590 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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