Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 AC100733.1-201ENSMUST00000228494 407 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm42548-201ENSMUST00000202669 3933 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Phf11d-201ENSMUST00000095157 2666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usp20Q8C6M1 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usp20Q8C6M1 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usp20Q8C6M1 Gm44991-201ENSMUST00000208669 479 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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Usp20Q8C6M1 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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Usp20Q8C6M1 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gabra6-201ENSMUST00000020703 2436 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Ugt2b1-201ENSMUST00000031183 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Kera-201ENSMUST00000105286 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Usp20Q8C6M1 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms