Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 1700061H18Rik-202ENSMUST00000147221 564 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 1700109G14Rik-203ENSMUST00000190737 801 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm23942-201ENSMUST00000101956 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm29525-201ENSMUST00000189844 699 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm29523-201ENSMUST00000191415 699 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Csn1s2a-203ENSMUST00000196749 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm6757-201ENSMUST00000189810 1706 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Olfr1229-203ENSMUST00000214593 3404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Ccdc18Q640L5 Gm15933-201ENSMUST00000117215 616 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm5263-201ENSMUST00000163646 601 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps127-201ENSMUST00000175850 1029 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm22423-201ENSMUST00000082861 184 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm37253-201ENSMUST00000195679 562 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Olfr251-201ENSMUST00000072731 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm44903-201ENSMUST00000206840 130 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 AC109172.2-201ENSMUST00000228792 381 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm5570-202ENSMUST00000101355 2527 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm18300-201ENSMUST00000192792 1406 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
Ccdc18Q640L5 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms