Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Zfp975-201ENSMUST00000107992 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm6884-201ENSMUST00000119318 615 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mir6986-201ENSMUST00000184483 58 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm37089-201ENSMUST00000195616 129 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC154733.1-201ENSMUST00000221126 679 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 CT030238.1-201ENSMUST00000228393 442 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm14326-204ENSMUST00000178829 1665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Ktn1-219ENSMUST00000190182 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr104-ps-201ENSMUST00000178766 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Ppef1-201ENSMUST00000071204 2483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm11600-201ENSMUST00000119592 240 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm26490-201ENSMUST00000157879 140 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm17669-201ENSMUST00000163749 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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Sh3bp2Q06649 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Zgrf1-202ENSMUST00000195955 3804 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Foxr2-202ENSMUST00000163801 3072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Mecom-212ENSMUST00000173495 5066 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Pfkfb2-202ENSMUST00000066863 4425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 AC131586.2-202ENSMUST00000227016 2705 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Sh3bp2Q06649 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms