Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm27543-201ENSMUST00000183562 177 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mir7074-201ENSMUST00000183884 63 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm24524-201ENSMUST00000082925 170 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm42447-201ENSMUST00000200102 2903 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Pappa2-202ENSMUST00000159861 9518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Vmn2r30-201ENSMUST00000072475 3616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Nlgn3-202ENSMUST00000118111 8004 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zfy1-201ENSMUST00000065545 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trp63-201ENSMUST00000040231 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 3732407C23Rik-201ENSMUST00000222770 3540 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Foxn3-201ENSMUST00000046859 7705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm12743-201ENSMUST00000126668 3700 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Cyld-205ENSMUST00000209532 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr457-203ENSMUST00000204324 4275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ctbp2-214ENSMUST00000169570 3604 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Igkv12-38-201ENSMUST00000103371 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Hnf1aos2-201ENSMUST00000138108 442 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm45820-201ENSMUST00000212068 362 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm25587-201ENSMUST00000082498 166 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Tyms-201ENSMUST00000026846 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Veph1-201ENSMUST00000029419 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Mlh3-201ENSMUST00000019378 5463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Map4k4-215ENSMUST00000195259 3719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Pm20d1-202ENSMUST00000112393 6900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Wrn-204ENSMUST00000211498 4856 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Cd200r3-209ENSMUST00000166731 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Msh4-205ENSMUST00000190449 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Ncald-204ENSMUST00000120746 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Aebp1-201ENSMUST00000102923 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zfp941-202ENSMUST00000106052 3851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Sgcd-202ENSMUST00000109220 2450 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 1500026H17Rik-201ENSMUST00000181598 3027 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Btbd18-201ENSMUST00000133437 3052 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Zfp759-201ENSMUST00000052716 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Trac-201ENSMUST00000103740 413 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 AL807824.1-201ENSMUST00000223151 183 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
Hoxd11P23813 Specc1-207ENSMUST00000201364 4955 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm10184-201ENSMUST00000086423 1939 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Nt5dc1-203ENSMUST00000105512 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Retreg1-203ENSMUST00000226438 2783 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gulp1-201ENSMUST00000074525 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr806-202ENSMUST00000213239 3724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Tex9-201ENSMUST00000085358 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Ano7-202ENSMUST00000186641 3984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Rbpj-208ENSMUST00000201912 5485 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Fam135b-201ENSMUST00000022953 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Tagap-201ENSMUST00000036370 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm4166-201ENSMUST00000220893 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Chd8-201ENSMUST00000089752 8190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Hoxd11P23813 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.5 ms