Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm7905-201ENSMUST00000119933 1386 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm6221-201ENSMUST00000180064 1386 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm45513-201ENSMUST00000210228 376 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Bcl2a1c-201ENSMUST00000066460 444 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Olfr814-203ENSMUST00000216966 3819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 A330048O09Rik-201ENSMUST00000180777 672 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm28675-201ENSMUST00000191096 675 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Pip-202ENSMUST00000203244 736 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm45571-201ENSMUST00000209671 569 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 AC153924.1-201ENSMUST00000220117 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ggta1P23336 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr924-202ENSMUST00000217350 3431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Mgat4c-201ENSMUST00000020039 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm3940-201ENSMUST00000105087 432 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm8260-201ENSMUST00000119230 353 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 1700052H01Rik-202ENSMUST00000196973 429 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm5551-201ENSMUST00000199720 690 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm45316-201ENSMUST00000210128 162 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AC144942.1-201ENSMUST00000220425 597 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 AC154640.2-201ENSMUST00000226324 472 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Rpl26-ps2-201ENSMUST00000085379 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm42968-201ENSMUST00000198578 1372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ggta1P23336 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms