Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r46-206ENSMUST00000228401 10955 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm15103-201ENSMUST00000119893 871 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Tmem167-ps3-201ENSMUST00000186718 178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Igkv5-40-1-201ENSMUST00000196457 359 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43405-201ENSMUST00000198642 337 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm13103-201ENSMUST00000094522 1833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC124746.1-201ENSMUST00000227535 1300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm20345-201ENSMUST00000175839 2414 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Igkv1-110-201ENSMUST00000103321 401 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm4732-201ENSMUST00000118778 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14159-201ENSMUST00000119832 451 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mup-ps13-201ENSMUST00000120662 545 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mup-ps1-201ENSMUST00000120720 544 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm11829-201ENSMUST00000121003 282 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm5958-201ENSMUST00000147698 297 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm26277-201ENSMUST00000157097 152 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm17038-201ENSMUST00000166586 494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm25535-201ENSMUST00000175364 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm28785-201ENSMUST00000187478 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm29524-201ENSMUST00000190819 699 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm17966-201ENSMUST00000193453 594 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm19126-201ENSMUST00000207896 509 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm33981-201ENSMUST00000219918 660 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 1700024I08Rik-203ENSMUST00000222372 754 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Tas2r118-201ENSMUST00000062463 900 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr194-201ENSMUST00000072608 921 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 CT009510.2-203ENSMUST00000226704 2136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CtcflA2APF3 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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