Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrit3W8DXL4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrit3W8DXL4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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