Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2U4

Elf4, ETS-related transcription factor Elf-4, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf4Q9Z2U4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Elf4Q9Z2U4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Elf4Q9Z2U4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Elf4Q9Z2U4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Elf4Q9Z2U4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Elf4Q9Z2U4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Elf4Q9Z2U4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Elf4Q9Z2U4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms