Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E4

Ppp1r17, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 17, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r17Q9Z2E4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ppp1r17Q9Z2E4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ppp1r17Q9Z2E4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms