Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mbd1Q9Z2E2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mbd1Q9Z2E2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms