Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Mbd3Q9Z2D8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Mbd3Q9Z2D8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms