Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VarsQ9Z1Q9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VarsQ9Z1Q9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms