Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cacna2d3Q9Z1L5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms