Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sh3bp5Q9Z131 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
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Sh3bp5Q9Z131 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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Sh3bp5Q9Z131 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Sh3bp5Q9Z131 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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Sh3bp5Q9Z131 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Sh3bp5Q9Z131 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sh3bp5Q9Z131 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms