Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NgfrQ9Z0W1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NgfrQ9Z0W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms