Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gbp2Q9Z0E6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gbp2Q9Z0E6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms