Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP4

Srd5a3, Polyprenol reductase, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srd5a3Q9WUP4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Srd5a3Q9WUP4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Srd5a3Q9WUP4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms