Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ramp3Q9WUP1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ramp3Q9WUP1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms