Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lemd3Q9WU40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lemd3Q9WU40 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms