Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU20

Mthfr, Methylenetetrahydrofolate reductase, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfrQ9WU20 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MthfrQ9WU20 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms