Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ggps1Q9WTN0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggps1Q9WTN0 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggps1Q9WTN0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggps1Q9WTN0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggps1Q9WTN0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ggps1Q9WTN0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms