Protein–RNA interactions for Protein: Q9R269

Ppl, Periplakin, mousemouse

Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PplQ9R269 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PplQ9R269 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PplQ9R269 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PplQ9R269 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms