Protein–RNA interactions for Protein: Q9R244

Trpc2, Short transient receptor potential channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc2Q9R244 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trpc2Q9R244 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trpc2Q9R244 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms