Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Slit2Q9R1B9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slit2Q9R1B9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms