Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q8

Clec4e, C-type lectin domain family 4 member E, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4eQ9R0Q8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec4eQ9R0Q8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms